Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
9230113P08RikD3YWX3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9230113P08RikD3YWX3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms