Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms