Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms