Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms