Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms