Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms