Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap58B2RW38 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms