Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usf3B2RUQ2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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