Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms