Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms