Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms