Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mbd5B1AYB6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mbd5B1AYB6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mbd5B1AYB6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Mbd5B1AYB6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mbd5B1AYB6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mbd5B1AYB6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mbd5B1AYB6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mbd5B1AYB6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mbd5B1AYB6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mbd5B1AYB6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mbd5B1AYB6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mbd5B1AYB6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms