Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700084M14RikB1AT01 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700084M14RikB1AT01 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms