Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Spocd1B1ASB6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms