Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-M5A7VMS3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-M5A7VMS3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-M5A7VMS3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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