Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3173A6NAS3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms