Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms