Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gm6880A3KG45 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gm6880A3KG45 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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