Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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