Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms