Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2al1jA2BFR3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2al1jA2BFR3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2al1jA2BFR3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2al1jA2BFR3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2al1jA2BFR3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2al1jA2BFR3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2al1jA2BFR3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2al1jA2BFR3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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