Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AgrnA2ASQ1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms