Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms