Protein–RNA interactions for Protein: A2AQH1

Cerkl, Ceramide kinase-like, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CerklA2AQH1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CerklA2AQH1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CerklA2AQH1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CerklA2AQH1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CerklA2AQH1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms