Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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