Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms