Protein–RNA interactions for Protein: A2ALU4

Shroom2, Protein Shroom2, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom2A2ALU4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Shroom2A2ALU4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms