Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FocadA2AKG8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms