Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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