Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms