Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms