Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Prdm2A2A7B5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms