Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calcoco2A2A6M5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms