Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Trav12-2A0N8N6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-2A0N8N6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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