Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms