Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JEU7

Ighv1-82, Immunoglobulin heavy variable 1-82 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-82A0A0G2JEU7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms