Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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