Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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