Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms