Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.1 ms