Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
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Uhrf1Q8VDF2 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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Uhrf1Q8VDF2 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
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Uhrf1Q8VDF2 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
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Uhrf1Q8VDF2 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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