Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm43814-201ENSMUST00000197851 413 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 AC187103.4-202ENSMUST00000225091 230 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms