Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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