Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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ptchd1Q14B62 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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