Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.4 ms