Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms