Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Brpf1B2RRD7 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms