Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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Rabgef1Q9JM13 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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