Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm26019-201ENSMUST00000104407 119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 AC100733.1-201ENSMUST00000228494 407 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm25821-201ENSMUST00000093657 133 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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