Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms